34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4523 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1034    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  98.41 
 
 
503 aa  1023    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  70.97 
 
 
521 aa  771    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  59.57 
 
 
512 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  56.97 
 
 
505 aa  628  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  57.88 
 
 
506 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  59.27 
 
 
507 aa  626  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  57.17 
 
 
507 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  59.75 
 
 
515 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  56.78 
 
 
505 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  57.37 
 
 
507 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  57.65 
 
 
507 aa  621  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  57.65 
 
 
507 aa  621  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  57.28 
 
 
506 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  58.54 
 
 
505 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  55.75 
 
 
504 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  55.89 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  55.44 
 
 
507 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  46.88 
 
 
512 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  46.69 
 
 
514 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  46.69 
 
 
512 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  44.38 
 
 
512 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  44.18 
 
 
507 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  43.68 
 
 
505 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  38.21 
 
 
521 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  36.51 
 
 
507 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  35.7 
 
 
500 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  51.69 
 
 
209 aa  253  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  25.83 
 
 
521 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  27.52 
 
 
541 aa  183  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  21.96 
 
 
544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  19.19 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  21.31 
 
 
517 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  21.31 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>