34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0352 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  92.23 
 
 		 507 aa  937    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  93.95 
 
 		 512 aa  938    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1037    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  45.96 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  44.53 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  43.44 
 
 		 507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  44.73 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  44.6 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  44.53 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  43.22 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  44.12 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  43.08 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  44.72 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  43.99 
 
 		 505 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  42.69 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  43.77 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  43.84 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  44.27 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  43.29 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  44.07 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  43.27 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  44.03 
 
 		 507 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  42.28 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  43.03 
 
 		 505 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  43.03 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  40.6 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  40.87 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  44.66 
 
 		 209 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  28.33 
 
 		 541 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  26.74 
 
 		 521 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  23.03 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  22.73 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  20.43 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  20.25 
 
 		 517 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>