34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0653 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1053    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  36.49 
 
 		 541 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  30.75 
 
 		 505 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  29.64 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  31.26 
 
 		 507 aa  228  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  29.73 
 
 		 521 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  31.21 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  30.68 
 
 		 504 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  30.8 
 
 		 507 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  29.48 
 
 		 507 aa  224  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  31.63 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  30.47 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  29.43 
 
 		 505 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  29.28 
 
 		 507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  29.53 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  29.77 
 
 		 512 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  30.12 
 
 		 507 aa  217  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  29.54 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  29.43 
 
 		 512 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  30.34 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  26.94 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  27.31 
 
 		 507 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  28 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  27.7 
 
 		 512 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  26.37 
 
 		 503 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  28.05 
 
 		 507 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  26.21 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  28.19 
 
 		 512 aa  193  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  27.2 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  24.18 
 
 		 544 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  25.76 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  23.55 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  23.57 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  30.95 
 
 		 209 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>