34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3029 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  80.55 
 
 
512 aa  888    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1047    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  78.52 
 
 
512 aa  849    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  49.32 
 
 
507 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  49.32 
 
 
507 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  50.5 
 
 
506 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  49.81 
 
 
505 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  48.64 
 
 
506 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  49.22 
 
 
505 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  50.2 
 
 
507 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  48.07 
 
 
521 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  50 
 
 
515 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  47.85 
 
 
507 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  47.27 
 
 
503 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  48.06 
 
 
504 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  47.29 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  46.68 
 
 
503 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  48.37 
 
 
507 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  46.63 
 
 
512 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  47.96 
 
 
507 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  47.35 
 
 
505 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  42.1 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  42.15 
 
 
505 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  42 
 
 
507 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  38.48 
 
 
507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  38.73 
 
 
521 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  35.53 
 
 
500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  50.49 
 
 
209 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  30.45 
 
 
521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  28.65 
 
 
541 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  23.27 
 
 
544 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  23.94 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  21.43 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  21.43 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>