34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1767 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1031    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  42.28 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  43 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  43.37 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  38.58 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  36.56 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  37.13 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  36.35 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  35.36 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  36.09 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  35.24 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  35.77 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  36.53 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  35.89 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  34.92 
 
 		 507 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  34.92 
 
 		 507 aa  363  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  36.46 
 
 		 515 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  35.25 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  35.24 
 
 		 507 aa  360  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  35.7 
 
 		 503 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  35.85 
 
 		 505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  35.57 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  35.36 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  36.72 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  35.24 
 
 		 521 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  35.95 
 
 		 514 aa  340  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  34.83 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  27.34 
 
 		 521 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  26.76 
 
 		 541 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  36.18 
 
 		 209 aa  156  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  20.99 
 
 		 544 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  21.93 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  21.75 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  21.41 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>