34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2866 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  1035    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  75.93 
 
 
507 aa  788    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  73.12 
 
 
507 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  76.79 
 
 
507 aa  824    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  77.38 
 
 
507 aa  830    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  74.31 
 
 
507 aa  792    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  73.85 
 
 
505 aa  786    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  76.28 
 
 
506 aa  828    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  75.1 
 
 
504 aa  804    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  73.08 
 
 
515 aa  773    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  73.99 
 
 
505 aa  785    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  76.39 
 
 
505 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  59.25 
 
 
512 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  70.95 
 
 
507 aa  755    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  70.49 
 
 
505 aa  761    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  57.94 
 
 
503 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  57.74 
 
 
503 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  57.52 
 
 
521 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  48.83 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  50.92 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  49.41 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  43.53 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  43.23 
 
 
505 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  43.55 
 
 
507 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  39.05 
 
 
507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  38.34 
 
 
521 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  36.35 
 
 
500 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  74.75 
 
 
209 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  28 
 
 
521 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  28.63 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  23.91 
 
 
544 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  19.47 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  19.69 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  19.39 
 
 
522 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>