100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2542 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2542  integrase, catalytic region  100 
 
 		 60 aa  126  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.158064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2024  integrase catalytic subunit  59.62 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2405  integrase catalytic subunit  59.62 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2174  integrase catalytic subunit  59.62 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0168  integrase catalytic subunit  59.62 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0055  integrase catalytic subunit  59.62 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000315593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1993  integrase catalytic subunit  58 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.140355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  58 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2605  Integrase catalytic region  51.85 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.238238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  56.86 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  56.86 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  56.86 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  56.86 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  56.86 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  56.86 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  56.86 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  56.86 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  56.86 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  56.86 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  56.86 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 273 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  56.86 
 
 		 300 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  45.16 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  45.16 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  45.16 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  45.16 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  45.16 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  45.16 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  45.16 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  45.16 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  45.16 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  52.83 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4353  insertion sequence 2 OrfB protein  48.21 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5774  transposase  54.9 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3181  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  52.94 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  52.94 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  52.94 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  52.94 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  52.94 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1920  IS2 ORF2  46.43 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0305  IS2 ORF2  46.3 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  43.55 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  49.06 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  43.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  49.06 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  49.06 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  51.79 
 
 		 277 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 		 277 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3118  IS2 transposase orfB  41.94 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0740  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 		 277 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3308  transposase  56.76 
 
 		 45 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4643  integrase catalytic region  43.4 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>