More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0424 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0424  magnesium and cobalt transport protein, putative  100 
 
 
316 aa  651    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_365  magnesium and cobalt transport protein  96.2 
 
 
316 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.391615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0400  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  94.3 
 
 
316 aa  618  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1169  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.05 
 
 
344 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.28 
 
 
332 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0303  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.47 
 
 
340 aa  205  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.162951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.93 
 
 
322 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.95 
 
 
355 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.19 
 
 
353 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.86 
 
 
353 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.21 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  29.77 
 
 
365 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.55 
 
 
368 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.79 
 
 
291 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.03 
 
 
322 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  30.07 
 
 
363 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.51 
 
 
354 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.39 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.95 
 
 
374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.2 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  28.21 
 
 
367 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  28.47 
 
 
358 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.57 
 
 
357 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.3 
 
 
354 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.12 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  28.01 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.49 
 
 
333 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.15 
 
 
354 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  30.63 
 
 
354 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.38 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.67 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  29 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.72 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.88 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.81 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.85 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.85 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.93 
 
 
354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.33 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.9 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.53 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.53 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.53 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.53 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  29.53 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  29.53 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  29.53 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.53 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.53 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.32 
 
 
354 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.19 
 
 
316 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.05 
 
 
354 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.06 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.83 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.56 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.92 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.04 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.91 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.35 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.83 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.84 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.27 
 
 
365 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.43 
 
 
322 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.35 
 
 
375 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.54 
 
 
327 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.33 
 
 
331 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.35 
 
 
353 aa  122  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.16 
 
 
390 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.04 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  26 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.3 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.68 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.35 
 
 
375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  25.4 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.1 
 
 
357 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.56 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.08 
 
 
322 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.1 
 
 
372 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.83 
 
 
387 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.57 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.35 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.95 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.01 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.62 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  26.62 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.26 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.23 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  26.02 
 
 
366 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.41 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.85 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.01 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.47 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  23.84 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.01 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.6 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.01 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.85 
 
 
547 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.1 
 
 
322 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.56 
 
 
322 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.08 
 
 
315 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>