More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0586 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
270 aa  546  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.158324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.64 
 
 
338 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  32.64 
 
 
338 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.92 
 
 
342 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.1 
 
 
340 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47390  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.43 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5240  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  37.14 
 
 
322 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.85 
 
 
335 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0483  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.27 
 
 
330 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.08 
 
 
345 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0303  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.33 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69140  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.33 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5979  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.14 
 
 
322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.2 
 
 
349 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.22 
 
 
336 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5273  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.1 
 
 
322 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5212  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.02 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.949607  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5453  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.29 
 
 
322 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.2 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.2 
 
 
349 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5121  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.61 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2861  hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5035  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.66 
 
 
322 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0359  FMN reductase  31.25 
 
 
232 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3000  hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.95 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0311  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.12 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3187  FMN reductase  30.64 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0291495  normal  0.0494092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3390  FMN reductase  30.83 
 
 
232 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3526  FMN reductase  32.08 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.79 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0505  FMN reductase  32.08 
 
 
232 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.61 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.874113  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0504  FMN reductase  31.25 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  33.06 
 
 
334 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.92 
 
 
343 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4445  FMN reductase  28.51 
 
 
236 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4366  FMN reductase  30.8 
 
 
233 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.783355  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.38 
 
 
342 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3058  FMN reductase  29.41 
 
 
232 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4187  FMN reductase  30.8 
 
 
233 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.712342  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4306  FMN reductase  30.8 
 
 
233 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 
354 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4210  FMN reductase  30.8 
 
 
233 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0959  FMN reductase  31.15 
 
 
235 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4259  FMN reductase  30.8 
 
 
233 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3951  FMN reductase  31.22 
 
 
233 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal  0.0174922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03476  FMN reductase  31.49 
 
 
231 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5283  FMN reductase  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0594419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03735  NAD(P)H-flavin reductase  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4137  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4363  FMN reductase  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4066  FMN reductase  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.676234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4166  FMN reductase  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000471832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4225  FMN reductase  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0771746  decreased coverage  0.000645847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03684  hypothetical protein  31.54 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4314  FMN reductase  31.54 
 
 
233 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0505  FMN reductase  31.67 
 
 
232 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.18 
 
 
343 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4046  FMN reductase  31.65 
 
 
233 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3935  FMN reductase  30.71 
 
 
233 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3986  FMN reductase  29.8 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3860  FMN reductase  29.8 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0504  FMN reductase  29.75 
 
 
236 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0281  FMN reductase  30.71 
 
 
233 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.493222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3804  FMN reductase  29.8 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1910  FMN reductase  30.71 
 
 
247 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0425  FMN reductase  28.75 
 
 
232 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4237  FMN reductase  31.65 
 
 
233 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0464  FMN reductase  29.8 
 
 
236 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.97 
 
 
349 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3905  FMN reductase  30.38 
 
 
233 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0708295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3353  FMN reductase  30 
 
 
232 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.72 
 
 
337 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0520  FMN reductase  28.51 
 
 
236 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.86 
 
 
343 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.86 
 
 
343 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.78 
 
 
343 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.04 
 
 
360 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.8 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  29.11 
 
 
327 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.8 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.8 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.8 
 
 
343 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 
348 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.24 
 
 
343 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0259  FMN reductase  31.25 
 
 
233 aa  99  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.45 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3638  FMN reductase  27.08 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  0.507176 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.71 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.71 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.71 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.83 
 
 
338 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.71 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.71 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.71 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.71 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  28.57 
 
 
350 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  27.92 
 
 
334 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>