More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3353 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3353  FMN reductase  100 
 
 
232 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3986  FMN reductase  91.95 
 
 
236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3804  FMN reductase  91.53 
 
 
236 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3860  FMN reductase  91.95 
 
 
236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0464  FMN reductase  91.95 
 
 
236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0505  FMN reductase  90.52 
 
 
232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0505  FMN reductase  90.09 
 
 
232 aa  447  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3526  FMN reductase  89.66 
 
 
232 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0504  FMN reductase  89.22 
 
 
232 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0504  FMN reductase  79.24 
 
 
236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4445  FMN reductase  79.24 
 
 
236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0359  FMN reductase  80.6 
 
 
232 aa  401  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0520  FMN reductase  80.08 
 
 
236 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3390  FMN reductase  79.74 
 
 
232 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0425  FMN reductase  79.74 
 
 
232 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3058  FMN reductase  77.16 
 
 
232 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00332  FMN reductase  50 
 
 
237 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002102  NAD(P)H-flavin reductase (NAD(P)H:flavin oxidoreductase)  49.58 
 
 
237 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000600107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0178  FMN reductase  51.23 
 
 
239 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4046  FMN reductase  47.21 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4237  FMN reductase  47.21 
 
 
233 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0152  FMN reductase  48.51 
 
 
236 aa  209  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3187  FMN reductase  44.16 
 
 
231 aa  207  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0291495  normal  0.0494092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2704  FMN reductase  46.19 
 
 
236 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147117  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4210  FMN reductase  44.64 
 
 
233 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4187  FMN reductase  44.64 
 
 
233 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.712342  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4306  FMN reductase  44.64 
 
 
233 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4366  FMN reductase  44.64 
 
 
233 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.783355  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4259  FMN reductase  44.64 
 
 
233 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3753  FMN reductase  46.35 
 
 
233 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1910  FMN reductase  45.92 
 
 
247 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3935  FMN reductase  45.92 
 
 
233 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0281  FMN reductase  45.92 
 
 
233 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.493222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3951  FMN reductase  45.06 
 
 
233 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal  0.0174922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4225  FMN reductase  44.21 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0771746  decreased coverage  0.000645847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4363  FMN reductase  44.21 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4314  FMN reductase  44.21 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3905  FMN reductase  44.21 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0708295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03735  NAD(P)H-flavin reductase  44.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4137  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5283  FMN reductase  44.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0594419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03684  hypothetical protein  44.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4166  FMN reductase  44.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000471832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4066  FMN reductase  44.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.676234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0259  FMN reductase  44.64 
 
 
233 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03476  FMN reductase  39.66 
 
 
231 aa  178  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0991  FMN reductase  40.51 
 
 
237 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3638  FMN reductase  40.43 
 
 
236 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  0.507176 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0959  FMN reductase  38.03 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0060  FMN reductase  37.92 
 
 
239 aa  160  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.19 
 
 
342 aa  151  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.16 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.19 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.75 
 
 
345 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.17 
 
 
340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06239  FMN reductase  35.78 
 
 
239 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.91 
 
 
336 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  33.04 
 
 
334 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.36 
 
 
342 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.12 
 
 
349 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.64 
 
 
338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  30.64 
 
 
338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.48 
 
 
341 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.92 
 
 
343 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  30.13 
 
 
341 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  29.38 
 
 
334 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.3 
 
 
329 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.3 
 
 
329 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.3 
 
 
329 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.05 
 
 
343 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.44 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.62 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.93 
 
 
348 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.51 
 
 
242 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.874113  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.2 
 
 
343 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.44 
 
 
351 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.67 
 
 
332 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3237  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.7 
 
 
333 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0483  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.17 
 
 
330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3000  hypothetical protein  30.04 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2861  hypothetical protein  30.04 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2326  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.33 
 
 
324 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0217103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.78 
 
 
354 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.78 
 
 
333 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2218  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.2 
 
 
324 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.37 
 
 
349 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.2 
 
 
343 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2319  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.87 
 
 
330 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0219052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  29.66 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.8 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.8 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.06 
 
 
343 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.96 
 
 
350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.25 
 
 
348 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.09 
 
 
338 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.41 
 
 
346 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 
343 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>