More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06239 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06239  FMN reductase  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0959  FMN reductase  45.06 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3638  FMN reductase  44.4 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  0.507176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002102  NAD(P)H-flavin reductase (NAD(P)H:flavin oxidoreductase)  40.34 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000600107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00332  FMN reductase  39.91 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0259  FMN reductase  38.56 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4046  FMN reductase  38.98 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3905  FMN reductase  37.71 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0708295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4237  FMN reductase  38.56 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0152  FMN reductase  38.63 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4225  FMN reductase  37.29 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0771746  decreased coverage  0.000645847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4363  FMN reductase  37.29 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4314  FMN reductase  37.29 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2704  FMN reductase  40.17 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03735  NAD(P)H-flavin reductase  37.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4137  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4066  FMN reductase  37.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.676234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03684  hypothetical protein  37.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4166  FMN reductase  37.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000471832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5283  FMN reductase  37.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0594419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3753  FMN reductase  37.29 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4259  FMN reductase  36.86 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4306  FMN reductase  36.86 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4366  FMN reductase  36.86 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.783355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4210  FMN reductase  36.86 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4187  FMN reductase  36.86 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.712342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3951  FMN reductase  36.02 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal  0.0174922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1910  FMN reductase  36.86 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3935  FMN reductase  36.86 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0281  FMN reductase  36.86 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.493222  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3187  FMN reductase  38.36 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0291495  normal  0.0494092 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0060  FMN reductase  36.75 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0520  FMN reductase  37.5 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3058  FMN reductase  36.64 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3390  FMN reductase  34.91 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03476  FMN reductase  34.32 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0505  FMN reductase  36.21 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3986  FMN reductase  35.78 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3860  FMN reductase  35.78 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3804  FMN reductase  35.78 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0504  FMN reductase  36.32 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0464  FMN reductase  35.34 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3353  FMN reductase  35.78 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4445  FMN reductase  34.05 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0505  FMN reductase  35.78 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3526  FMN reductase  35.34 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0504  FMN reductase  33.62 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0178  FMN reductase  36.86 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0991  FMN reductase  33.33 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0359  FMN reductase  34.91 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0425  FMN reductase  34.05 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.19 
 
 		 335 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.91 
 
 		 331 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.23 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.93 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.04 
 
 		 328 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.76 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.51 
 
 		 342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  31.51 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.96 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.58 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0575  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.91 
 
 		 321 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.74 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.02 
 
 		 351 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  33.33 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  31.69 
 
 		 353 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.47 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.47 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7472  ferredoxin  29.41 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.554725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.75 
 
 		 349 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.37 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.37 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  31.36 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.17 
 
 		 349 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.49 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  31.28 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.53 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.41 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.61 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.33 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.18 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  29.22 
 
 		 338 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.22 
 
 		 338 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.76 
 
 		 343 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2508  oxygenase, putative  30.6 
 
 		 324 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  30.57 
 
 		 327 aa  98.6  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  28.99 
 
 		 334 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  27.73 
 
 		 342 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  30.09 
 
 		 353 aa  98.2  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.76 
 
 		 343 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.86 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.82 
 
 		 357 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.33 
 
 		 343 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.33 
 
 		 343 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.33 
 
 		 343 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.33 
 
 		 343 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0772  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.9 
 
 		 321 aa  96.3  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27 
 
 		 343 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>