More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4137 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03735  NAD(P)H-flavin reductase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4137  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4166  FMN reductase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000471832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03684  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4066  FMN reductase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.676234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5283  FMN reductase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0594419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4363  FMN reductase  99.57 
 
 
233 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4225  FMN reductase  99.57 
 
 
233 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0771746  decreased coverage  0.000645847 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4314  FMN reductase  98.28 
 
 
233 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4306  FMN reductase  90.56 
 
 
233 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4366  FMN reductase  90.99 
 
 
233 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.783355  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4210  FMN reductase  90.56 
 
 
233 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4187  FMN reductase  90.56 
 
 
233 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.712342  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4259  FMN reductase  90.13 
 
 
233 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3951  FMN reductase  86.7 
 
 
233 aa  424  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal  0.0174922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1910  FMN reductase  77.68 
 
 
247 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3935  FMN reductase  77.68 
 
 
233 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0281  FMN reductase  77.68 
 
 
233 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.493222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4046  FMN reductase  77.25 
 
 
233 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0259  FMN reductase  77.68 
 
 
233 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4237  FMN reductase  76.82 
 
 
233 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3753  FMN reductase  74.68 
 
 
233 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3905  FMN reductase  73.82 
 
 
233 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0708295  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0060  FMN reductase  51.91 
 
 
239 aa  264  7e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0152  FMN reductase  53.19 
 
 
236 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002102  NAD(P)H-flavin reductase (NAD(P)H:flavin oxidoreductase)  48.31 
 
 
237 aa  235  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000600107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2704  FMN reductase  48.51 
 
 
236 aa  231  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00332  FMN reductase  47.03 
 
 
237 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0959  FMN reductase  45.3 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0359  FMN reductase  46.35 
 
 
232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03476  FMN reductase  46.35 
 
 
231 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0505  FMN reductase  45.92 
 
 
232 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3526  FMN reductase  45.49 
 
 
232 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0505  FMN reductase  45.92 
 
 
232 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3390  FMN reductase  45.06 
 
 
232 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0504  FMN reductase  45.06 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0464  FMN reductase  45.23 
 
 
236 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3804  FMN reductase  44.81 
 
 
236 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3860  FMN reductase  44.81 
 
 
236 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3986  FMN reductase  44.81 
 
 
236 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3353  FMN reductase  44.21 
 
 
232 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0425  FMN reductase  43.78 
 
 
232 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4445  FMN reductase  44.73 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0504  FMN reductase  44.3 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3187  FMN reductase  43.35 
 
 
231 aa  194  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0291495  normal  0.0494092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3058  FMN reductase  42.49 
 
 
232 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0520  FMN reductase  42.62 
 
 
236 aa  191  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3638  FMN reductase  39.74 
 
 
236 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  0.507176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0991  FMN reductase  43.7 
 
 
237 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0178  FMN reductase  40.66 
 
 
239 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06239  FMN reductase  37.29 
 
 
239 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.02 
 
 
345 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  35.51 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.62 
 
 
343 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.2 
 
 
343 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3237  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.76 
 
 
333 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.93 
 
 
337 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.12 
 
 
354 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.71 
 
 
351 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 
343 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.92 
 
 
349 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.91 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.93 
 
 
342 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.08 
 
 
349 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.48 
 
 
335 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.87 
 
 
329 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.2 
 
 
343 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.87 
 
 
329 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.49 
 
 
357 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.43 
 
 
329 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.5 
 
 
349 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 
343 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.08 
 
 
348 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.04 
 
 
332 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7472  ferredoxin  32.61 
 
 
292 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.554725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.21 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.22 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.83 
 
 
349 aa  118  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.79 
 
 
343 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.79 
 
 
343 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.79 
 
 
343 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.79 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.65 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.9 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.22 
 
 
350 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.94 
 
 
343 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.36 
 
 
343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.06 
 
 
333 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.06 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4909  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.78 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.34 
 
 
350 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.91 
 
 
346 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  30.74 
 
 
334 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>