More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3992 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.874113  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5453  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.87 
 
 
322 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5240  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  36.1 
 
 
322 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0303  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.68 
 
 
322 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5212  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.89 
 
 
322 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.949607  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5121  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.89 
 
 
322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5273  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.89 
 
 
322 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5035  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.73 
 
 
322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0311  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 
322 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0483  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.07 
 
 
330 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5979  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.73 
 
 
322 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69140  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.31 
 
 
322 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47390  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.58 
 
 
322 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.17 
 
 
342 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0504  FMN reductase  31.4 
 
 
236 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0505  FMN reductase  32.35 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3353  FMN reductase  31.51 
 
 
232 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.17 
 
 
345 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0152  FMN reductase  32.78 
 
 
236 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0505  FMN reductase  31.51 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0425  FMN reductase  31.49 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0504  FMN reductase  31.09 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4445  FMN reductase  29.71 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002102  NAD(P)H-flavin reductase (NAD(P)H:flavin oxidoreductase)  32.22 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000600107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0520  FMN reductase  30.99 
 
 
236 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3058  FMN reductase  31.49 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0991  FMN reductase  28.75 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3526  FMN reductase  31.09 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.16 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3804  FMN reductase  31.28 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0464  FMN reductase  31.28 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3860  FMN reductase  31.28 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3986  FMN reductase  31.28 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4306  FMN reductase  28.81 
 
 
233 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4210  FMN reductase  28.81 
 
 
233 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.61 
 
 
270 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.158324  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4187  FMN reductase  28.81 
 
 
233 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.712342  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03476  FMN reductase  28.94 
 
 
231 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4259  FMN reductase  28.81 
 
 
233 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.8 
 
 
349 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.15 
 
 
338 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  28.15 
 
 
338 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4366  FMN reductase  28.39 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.783355  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3390  FMN reductase  31.91 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.36 
 
 
337 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.39 
 
 
340 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00332  FMN reductase  31.38 
 
 
237 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.63 
 
 
343 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  27.94 
 
 
342 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3905  FMN reductase  29.46 
 
 
233 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0708295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.16 
 
 
350 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4046  FMN reductase  27.97 
 
 
233 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0359  FMN reductase  30.21 
 
 
232 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0959  FMN reductase  28.51 
 
 
235 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.05 
 
 
343 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.05 
 
 
343 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0281  FMN reductase  27.97 
 
 
233 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.493222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3935  FMN reductase  27.97 
 
 
233 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1910  FMN reductase  27.97 
 
 
247 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0259  FMN reductase  30.38 
 
 
233 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4363  FMN reductase  27.54 
 
 
233 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4225  FMN reductase  27.54 
 
 
233 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0771746  decreased coverage  0.000645847 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2704  FMN reductase  27.73 
 
 
236 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.93 
 
 
354 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.4 
 
 
346 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03735  NAD(P)H-flavin reductase  27.97 
 
 
233 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4137  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.97 
 
 
233 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4314  FMN reductase  27.54 
 
 
233 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4066  FMN reductase  27.97 
 
 
233 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.676234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03684  hypothetical protein  27.97 
 
 
233 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4237  FMN reductase  27.12 
 
 
233 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5283  FMN reductase  27.97 
 
 
233 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0594419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3951  FMN reductase  27.12 
 
 
233 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal  0.0174922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4166  FMN reductase  27.97 
 
 
233 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000471832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.69 
 
 
332 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.28 
 
 
346 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.34 
 
 
351 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.63 
 
 
348 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0178  FMN reductase  29.1 
 
 
239 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  25.53 
 
 
334 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.05 
 
 
357 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0060  FMN reductase  28.87 
 
 
239 aa  101  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3753  FMN reductase  26.69 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.49 
 
 
343 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.49 
 
 
343 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.34 
 
 
360 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  26.94 
 
 
334 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.25 
 
 
335 aa  99  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.74 
 
 
354 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.09 
 
 
343 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.09 
 
 
343 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.09 
 
 
343 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.69 
 
 
349 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.09 
 
 
343 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.2 
 
 
348 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.87 
 
 
349 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.91 
 
 
342 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.8 
 
 
350 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.09 
 
 
343 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  25.82 
 
 
350 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>