134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2780 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2780  rubrerythrin  100 
 
 		 126 aa  266  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.588149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  49.4 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  45.78 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  45.78 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  45.98 
 
 		 196 aa  73.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  40.59 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  50.62 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  44.19 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  45.78 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  43.21 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  43.37 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  55.38 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  40.4 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  41.98 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  40.4 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  43.75 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  43.9 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  44.3 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  43.59 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  45.57 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  45.59 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  42.68 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  44.3 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  46.84 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  44.44 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  41.86 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  48.65 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  53.23 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  40.51 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  41.77 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  40.96 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  48.65 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  43.42 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  44.16 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  42.86 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  37.5 
 
 		 179 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  40.96 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  35.65 
 
 		 194 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  43.24 
 
 		 194 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  40.51 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  27.59 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  41.89 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  39.02 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  40.22 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  43.24 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  49.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  36.71 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  44.12 
 
 		 696 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.66 
 
 		 696 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  48.33 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  46.03 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  44.26 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  46.03 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  47.62 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  43.94 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  43.94 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  44.44 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  43.55 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  52.73 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  37.21 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  44.26 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  36.96 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  44.83 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  46.3 
 
 		 215 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  40.62 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  39.68 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  35.35 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  35.35 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  35.35 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  35.35 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  28.87 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  32.14 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  35.29 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  33.67 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  34.38 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.37 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  44.64 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  31.19 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  38.46 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  34.34 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  40.58 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  34.34 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  36.78 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.52 
 
 		 237 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  31.18 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  35.63 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  30.97 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  32.67 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  32.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  30.97 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  32.14 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  36.84 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  36.78 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>