67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0716 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0640  filamentation induced by cAMP protein Fic  80.72 
 
 		 501 aa  825    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0716  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 498 aa  1022    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1784  fic family protein  76.14 
 
 		 393 aa  591  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0465792 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.95 
 
 		 499 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2183  fic family protein  39.28 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723486  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.11 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4097  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.83 
 
 		 544 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  25.46 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.64 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.81 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.38 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  28.78 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.34 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  23.94 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.83 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.02 
 
 		 250 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.04 
 
 		 267 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.05 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.81 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.53 
 
 		 267 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.58 
 
 		 529 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.64 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.91 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.87 
 
 		 247 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  27.55 
 
 		 253 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  50.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  24.54 
 
 		 377 aa  50.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 245 aa  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.96 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  27.91 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  23.17 
 
 		 348 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.27 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  23.17 
 
 		 348 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.8 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  29.17 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 387 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.82 
 
 		 248 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  27.04 
 
 		 253 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.46 
 
 		 389 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.2 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.67 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.92 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.06 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.09 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.77 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.63 
 
 		 391 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.71 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  24.87 
 
 		 377 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.79 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.94 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  24 
 
 		 249 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  29.11 
 
 		 271 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.83 
 
 		 253 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.75 
 
 		 371 aa  43.5  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.02 
 
 		 251 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.91 
 
 		 359 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 		 392 aa  43.5  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.38 
 
 		 326 aa  43.1  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>