36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2442 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  100 
 
 
160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  35.76 
 
 
166 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  35.8 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  38.73 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  34.55 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  32.68 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  37.75 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  36.08 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  34.15 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  35.25 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  32.89 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  36.62 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  35.62 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  31.25 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  32.28 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  29.73 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  34.56 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  30.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.94 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  30.66 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  29.93 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  29.93 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  35.96 
 
 
283 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  29.08 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  32.09 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  27.04 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  30.56 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  34.27 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  34.25 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1175  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  33.56 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  25.69 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1235  hypothetical protein  33.9 
 
 
266 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  32.74 
 
 
275 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1337  FixH family protein  33.9 
 
 
266 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  26.05 
 
 
273 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>