38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3325 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  100 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  35.9 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  35.92 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  33.73 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  29.89 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  31.58 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  31.82 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  29.53 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  29.94 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  27.84 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  29.25 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  31.03 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  29.49 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  30.3 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  27.91 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  34.67 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  28.39 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  24.65 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  29.87 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  30.87 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  30.14 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  30.14 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  32.68 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.66 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  31.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  30.43 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  26.81 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  23.9 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  23.9 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  23.9 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  23.53 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  31.54 
 
 		 152 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  23.27 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  25.62 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2079  hypothetical protein  25.6 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.488973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>