34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7462 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  100 
 
 		 166 aa  329  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  71.08 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  42.41 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  43.45 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  45.22 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  38.79 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  44 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  40.24 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  39.61 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  31.87 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  35.76 
 
 		 160 aa  84  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  35.57 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  35.14 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  32.87 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  35.33 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  32.48 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  33.13 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  33.73 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  32.89 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  29.56 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  28.57 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  28.57 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  31.58 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  30.26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  29.13 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  31.76 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  28.85 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  27.01 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  29.93 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  28.1 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  27.75 
 
 		 275 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  26.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  24.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>