39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1154 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  100 
 
 
156 aa  318  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  34.31 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  38.73 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  36.69 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  35 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  32.87 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  35.04 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  37.78 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  34.01 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  33.33 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  32.19 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  32.28 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  30.41 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  30.41 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  35.51 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  34.04 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  32.59 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.25 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  37.5 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  29.49 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  35.87 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3045  FixH family protein  35.2 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  25.62 
 
 
267 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  39.76 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  24.48 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  28.39 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0343  hypothetical protein  25.29 
 
 
260 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.011657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1232  hypothetical protein  31.93 
 
 
153 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  31.88 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  32.12 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  32.12 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  22.67 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  26.81 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  25.74 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  25.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  25.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  25.81 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  25.74 
 
 
159 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  25.74 
 
 
159 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>