32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2796 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  100 
 
 		 148 aa  300  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  64.86 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  64.63 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  62.84 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  61.9 
 
 		 166 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  44.22 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  44 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  40.41 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  40 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  28.57 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  32.28 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  32.28 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  32.14 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  32.37 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  28.68 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  35.16 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  29.63 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  29.81 
 
 		 275 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.49 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  34.38 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  28.89 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  27.46 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  30.17 
 
 		 267 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  31.68 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  25.85 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  29.32 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  28.57 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  40.74 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  25.17 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  25.17 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  31.16 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0087  hypothetical protein  21.37 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.01404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>