33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0010 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0010  FixH  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  69.28 
 
 		 166 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  70.48 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  69.28 
 
 		 166 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  64.63 
 
 		 148 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  43.45 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  43.67 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  40.26 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  44.03 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  36.69 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  34.55 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  30.32 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.03 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  34.55 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  38.46 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  31.65 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.53 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  24.52 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  27.78 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  31.37 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  26.06 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  27.54 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  23.94 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  28.75 
 
 		 275 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  31.41 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  23.94 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  31.93 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  30.77 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  23.84 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  29.37 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  23.6 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  25.29 
 
 		 167 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>