31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2539 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2539  FixH  100 
 
 		 158 aa  330  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  57.43 
 
 		 155 aa  191  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  54.17 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  49.33 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  47.33 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  47.33 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  44.16 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  35.48 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  32.91 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  32.91 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  31.82 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  34.87 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  41.51 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  31.94 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  33.58 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  33.81 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  33.13 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  32.64 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  35.62 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  30 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  30.94 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  30.63 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  30.41 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  35.16 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  53.85 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  27.78 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  35.87 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  28.75 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  30.43 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1175  hypothetical protein  32.73 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1235  hypothetical protein  34.23 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>