17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1875 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  32.32 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  30.54 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0634  hypothetical protein  27.53 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  32.1 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  34.55 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0343  hypothetical protein  24.29 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  29.87 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  31.76 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  28.76 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  25.62 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  30.17 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  28.32 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  31.13 
 
 		 168 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  28.92 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0087  hypothetical protein  23.33 
 
 		 168 aa  42.7  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.01404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  27.96 
 
 		 186 aa  42  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>