30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0666 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  100 
 
 
155 aa  321  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  57.43 
 
 
158 aa  191  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  54.79 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  50.34 
 
 
152 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  50.34 
 
 
152 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  47.65 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  43.59 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  38.16 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  38.16 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  38.16 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  32.41 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  36.84 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  31.62 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  35.46 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  32.48 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  31.91 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  26.99 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  36.17 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  35.05 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  39.76 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.87 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  32.63 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  34.02 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  30.56 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  31.68 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  31.93 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  29.63 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  26.67 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  26.8 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  33.64 
 
 
283 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>