29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5021 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  100 
 
 
161 aa  331  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  69.43 
 
 
161 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  49.67 
 
 
164 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  45.51 
 
 
167 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  45.04 
 
 
165 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  42.75 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  42.75 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  31.17 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  31.62 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  35.94 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  29.56 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  32.82 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  31.54 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  31.54 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  33.08 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  31.25 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  27.54 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  27.04 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  28.39 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  29.55 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  28.47 
 
 
171 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  28.15 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  25.47 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  26.14 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  26.35 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  23.27 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  27.4 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  23.91 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  21.38 
 
 
166 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>