26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2391 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  100 
 
 		 164 aa  340  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  49.67 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  51.7 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  47.55 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  44.06 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  44.06 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  44.06 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  31.62 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  35.46 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  29.73 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  28.57 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  53.85 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  29.37 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  27.01 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  27.27 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  26.09 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  52.83 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  22.98 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  24.85 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  51.06 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  51.06 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  23.6 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  46.3 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  26.81 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  26.76 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  25.62 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>