26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4957 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  69.43 
 
 
161 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  51.7 
 
 
164 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  44.08 
 
 
167 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  47.06 
 
 
165 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  45.59 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  45.59 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  33.58 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  39.01 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  36.69 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  31.91 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  37.01 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  36.36 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  35.97 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  29.77 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  33.58 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  28.1 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  29.08 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  32.58 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  28.37 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  30.28 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  30.07 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  26.32 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  26.67 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  25.81 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  25.36 
 
 
166 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>