154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7116 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7116  integral membrane protein interacts with FtsH  100 
 
 		 218 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0479  protein of unknown function UPF0005  43.96 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  32.62 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  32.94 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  31.19 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  27.85 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  29.65 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  29.07 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  29.07 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  28.57 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  29 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  34.35 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  32.86 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  30.23 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  28.18 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  27.98 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  28.39 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  31.02 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  31.02 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  34.35 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  29.07 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  29.07 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  29.07 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  29.31 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  36.36 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  30.32 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  31.3 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  29.07 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  32.93 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  29.07 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  27.95 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  29.07 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  31.25 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  30.34 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  30.77 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  30.77 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  32.46 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0272  membrane protein  27.07 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000292393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  34.23 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  29.9 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1398  hypothetical protein  28.22 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  25.6 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  29.44 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  24.86 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0393  protein of unknown function UPF0005  28.89 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  29.91 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  30.09 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  32.06 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  30.94 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0993  integral membrane protein, interacts with FtsH  26.99 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000120831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0206  hypothetical protein  26.92 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  30.41 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1268  integral membrane protein, interacts with FtsH  28.99 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.01414  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1502  integral membrane protein, interacts with FtsH  26.63 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.230664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  29.87 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  31.36 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  34.19 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  28.89 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  32.87 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  30.28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2054  hypothetical protein  26.07 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.213667  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  30.28 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  30.28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  32.61 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  30.28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  30.28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  27.62 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  35.92 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  30.56 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  30.36 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  29.31 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  29.31 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  30.22 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  27.86 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  31.93 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  30.41 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  26.95 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  29.63 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  27.37 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>