29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4749 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  100 
 
 		 129 aa  246  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  49.57 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  47.86 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  46.15 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  41.03 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  41.03 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  42.71 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  45.05 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  40.68 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  44.33 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  41.53 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  37.11 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  36.67 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  40 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  35.83 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  38.32 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  43.33 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  37.21 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  38.64 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  34.19 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  45.83 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  40.74 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>