29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1511 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  69.92 
 
 
123 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  65.85 
 
 
123 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  59.68 
 
 
124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  52 
 
 
127 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  56.1 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  54.24 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  52.54 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  49.18 
 
 
125 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  56.91 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  45.08 
 
 
123 aa  106  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  48 
 
 
126 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  49.59 
 
 
124 aa  104  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  48.39 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  47.92 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  51.26 
 
 
119 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  47.29 
 
 
130 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  47.75 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  44.09 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  42.61 
 
 
121 aa  87  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  40.83 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  48.36 
 
 
132 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  39.32 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  36.75 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  45.12 
 
 
191 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  34.92 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  36 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  35.54 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>