20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4770 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  100 
 
 		 136 aa  265  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  53.33 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  49.6 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  39.68 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  36.07 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  36.07 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  37.76 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1288  hypothetical protein  37.31 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5238  DoxX family protein  39.76 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  40.26 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  32.32 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  35.54 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  34.68 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  29.91 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  31.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2514  hypothetical protein  36.78 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  35.82 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  36.36 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  40.74 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>