27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4595 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  245  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  59.52 
 
 
135 aa  160  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  51.43 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  43.44 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  43.22 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  36.75 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  38.46 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  36.75 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  36.13 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  38.18 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  42.7 
 
 
191 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  35.9 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  38.46 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  36.13 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  37.12 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  34.38 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  39.22 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  31.85 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  31.5 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  33.05 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  38.68 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  32.29 
 
 
129 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  28.81 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  34.38 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>