22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2972 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2972  DoxX  100 
 
 		 118 aa  224  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  56.25 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1536  DoxX family protein  41.56 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2822  DoxX family protein  40.48 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2840  DoxX family protein  40.48 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.78711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2965  DoxX family protein  40.48 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.619526  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1684  hypothetical protein  42.67 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1615  hypothetical protein  41.33 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1690  hypothetical protein  41.33 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  33.94 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  33.33 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  33.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  31.53 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  36.59 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  32.32 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  39.19 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  32.56 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  52.17 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  34 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1503  hypothetical protein  32.61 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000082218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3794  DoxX family protein  31.18 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  40.35 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>