29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5894 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  100 
 
 		 132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5096  DoxX family protein  62.12 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3794  DoxX family protein  46.85 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4117  DoxX family protein  47.87 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3133  hypothetical protein  33.96 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  33.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0947  hypothetical protein  33.93 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00033255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000313145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.049642  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4100  DoxX family protein  37.11 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2900  hypothetical protein  35.24 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000507165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  36.28 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2922  hypothetical protein  34.91 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3144  hypothetical protein  34.91 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3156  hypothetical protein  34.91 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.245653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  36.19 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  33.96 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1345  hypothetical protein  38.27 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5238  DoxX family protein  44.29 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3126  hypothetical protein  41.38 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  37.14 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  39.05 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  39.05 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  32.67 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0579  hypothetical protein  36.76 
 
 		 165 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>