23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1995 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  100 
 
 		 132 aa  248  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  98.48 
 
 		 159 aa  246  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  80.92 
 
 		 133 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  65.85 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5238  DoxX family protein  56.31 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  52.38 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  43.2 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  36.07 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0947  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1036  hypothetical protein  36.07 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.049642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1114  hypothetical protein  36.07 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000313145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0969  hypothetical protein  36.07 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00033255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0957  hypothetical protein  35.25 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3794  DoxX family protein  37.93 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  33.33 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1288  hypothetical protein  39.45 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  36.52 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  35.87 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  40.79 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1536  DoxX family protein  28.24 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2965  DoxX family protein  31.63 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.619526  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2840  DoxX family protein  31.63 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.78711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2822  DoxX family protein  31.63 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>