37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5995 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  100 
 
 
147 aa  293  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  53.33 
 
 
136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  55.83 
 
 
134 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  43.85 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  44 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  41.8 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  43.2 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  40.32 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1288  hypothetical protein  35 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  36.29 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  35.45 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  39.81 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5238  DoxX family protein  37.08 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  36 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  36.8 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  38.21 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  34.4 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  37.29 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  32.56 
 
 
118 aa  48.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  39.17 
 
 
124 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  35.29 
 
 
124 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  37.08 
 
 
120 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  32.81 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  37.14 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0957  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1114  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000313145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1036  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.049642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0969  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00033255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  37.11 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0947  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  36.96 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  37.97 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  36.71 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  31.19 
 
 
122 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  36.56 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>