23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4937 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  347  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  47.22 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  36.59 
 
 
135 aa  88.2  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  43.44 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  39.32 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  36.75 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  34.51 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  44.58 
 
 
124 aa  62  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  33.05 
 
 
124 aa  57.4  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  36.29 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  32.48 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  32.48 
 
 
118 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  34.75 
 
 
125 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  35 
 
 
126 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  31.93 
 
 
127 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  33.9 
 
 
191 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  37.5 
 
 
129 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  36.08 
 
 
124 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  33.03 
 
 
121 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  35.82 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  31.96 
 
 
119 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>