27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2609 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  230  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  62.6 
 
 
123 aa  149  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  57.72 
 
 
123 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  56.1 
 
 
123 aa  135  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  59.68 
 
 
124 aa  130  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  50.85 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  54.4 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  51.64 
 
 
124 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  50.81 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  50 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  45.53 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  49.59 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  51.61 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  45.76 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  50.53 
 
 
129 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  40.17 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  45.95 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  44.33 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  42.98 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  47.11 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  37.61 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  41.32 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  35.04 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  40.31 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  36.75 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.231032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>