25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5906 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  59.52 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  36.59 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  41.94 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  40.83 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  40 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  41.32 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  40.17 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  39.32 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  38.02 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  35.25 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  33.33 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  36.28 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  35.77 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  35.59 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  31.4 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  41.24 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  39.58 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  33.06 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  34.31 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  32.29 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  32.81 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>