27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3024 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  100 
 
 		 125 aa  233  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  49.18 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  47.58 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  46.77 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  49.19 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  43.7 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  49.19 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  45.16 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  47.54 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  42.86 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  40.8 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  46.08 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  38.02 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  40 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  37.93 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  45.36 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  43.3 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  40.48 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  42.98 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  39.34 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  44.32 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  34.75 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  36.89 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  33.05 
 
 		 126 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>