27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0416 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  100 
 
 
123 aa  234  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  62.1 
 
 
124 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  52.42 
 
 
124 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  58.33 
 
 
124 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  45.08 
 
 
123 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  51.82 
 
 
118 aa  103  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  52.21 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  41.46 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  45.16 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  44.8 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  40.65 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  45.53 
 
 
123 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  50.5 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  45.95 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  46.72 
 
 
124 aa  87.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  46.46 
 
 
119 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  45.54 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  38.74 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  47.52 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  42.4 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  37.14 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  39.8 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  41.67 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  36.56 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  36.26 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.231032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>