27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  100 
 
 
124 aa  235  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  58.2 
 
 
124 aa  117  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  48.36 
 
 
123 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  47.58 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  44.26 
 
 
123 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  50.82 
 
 
123 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  47.15 
 
 
124 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  46.72 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  46.77 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  41.18 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  40.8 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  45.53 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  46.34 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  47.42 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  45.83 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  40.34 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  46.88 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  41.28 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  35.59 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  40.66 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  40.16 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  44.05 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  31.52 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  33.33 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  36.56 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>