27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2652 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  100 
 
 
124 aa  229  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  67.74 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  62.1 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  56.91 
 
 
123 aa  123  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  54.03 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  60.61 
 
 
119 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  56.3 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  56.35 
 
 
127 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  49.19 
 
 
123 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  49.19 
 
 
125 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  56.1 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  52.1 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  51.61 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  54.08 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  47.06 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  46.34 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  46.08 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  44.33 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  49.02 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  39.22 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  43.01 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  34.69 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  33.06 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  36.96 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>