22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0608 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  100 
 
 
130 aa  253  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  47.29 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  40.31 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  40.31 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  39.53 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  37.69 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  42.98 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  41.3 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  42.11 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  36.92 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  43.53 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  43.01 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  35.66 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  44.09 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  39.8 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  39.8 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  40 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  34.09 
 
 
191 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  38.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  39.6 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  36.56 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>