25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4831 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  261  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  68.03 
 
 
124 aa  186  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  72.13 
 
 
124 aa  186  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  68.46 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  62.99 
 
 
127 aa  176  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  39.83 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  40.71 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3402  hypothetical protein  36.07 
 
 
189 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  42.05 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  36.52 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  34.91 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  39.8 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0382  hypothetical protein  35.85 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  36.08 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  35.11 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  38.1 
 
 
132 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0579  hypothetical protein  34.25 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1073  hypothetical protein  29.63 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0947  hypothetical protein  32.26 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4117  DoxX family protein  28.92 
 
 
98 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>