21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5772 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  270  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  40.32 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  43.36 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  40.71 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  40.71 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  40.71 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  43.64 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  41.75 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3402  hypothetical protein  38.14 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  40.7 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  35.2 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  34.96 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  36.75 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  38.05 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  30.48 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  28.68 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  32.98 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  30.89 
 
 
133 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0382  hypothetical protein  39.29 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3326  hypothetical protein  31.37 
 
 
135 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.333585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>