20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0582 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  74.8 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  73.02 
 
 		 133 aa  191  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  40.22 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  30.33 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  31.97 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  33.91 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  28.68 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  28.69 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  36.26 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  36.59 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  39.02 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  30.68 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3402  hypothetical protein  30.36 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  29.66 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3326  hypothetical protein  26.17 
 
 		 135 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.333585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>