21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3265 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  256  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  51.26 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  45.69 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  47.9 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  42.5 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  39.5 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  34.96 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  33.91 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0382  hypothetical protein  38.54 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  35.64 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  30.17 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  33.91 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  33.91 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  31.15 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  36.89 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  28.69 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  34.04 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1063  hypothetical protein  48.84 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3402  hypothetical protein  37.5 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  27.93 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>