20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3835 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  52.94 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  37.82 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  42.5 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  35.2 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  40.5 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  35.05 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0382  hypothetical protein  35.64 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  34.51 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  32.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  34.09 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  33.07 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  28.81 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  32.52 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  30.58 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  31.93 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  33.93 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1063  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  35.09 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>