23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2123 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  247  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  72.95 
 
 
124 aa  187  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  71.9 
 
 
127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  68.03 
 
 
131 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  66.39 
 
 
130 aa  167  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  40.71 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3402  hypothetical protein  36.52 
 
 
189 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  36.13 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  39.64 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  33.91 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  40.86 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  31.36 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  32.79 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  33.91 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  37.36 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  39.78 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  33.68 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  31.87 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0382  hypothetical protein  43.55 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  40 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0579  hypothetical protein  33.8 
 
 
165 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3794  DoxX family protein  30.93 
 
 
120 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>